Tahun 2021 menjadi salah satu momen penting dalam perjalanan Eddy di kepolisian untuk menanggulangi terorisme. Sebab, di tahun tersebut, ia juga mengemban tugas sebagai Widyaiswara Kepolisian Utama Tingkat I Sespim Lemdiklat Polri.
Tiga tahun kemudian, yakni pada 2024, Eddy ditunjuk menjadi Kepala BNPT untuk periode pertamanya oleh Presiden ke-7 RI Joko Widodo. Sehingga, dengan penunjukan dirinya sebagai Kepala BNPT oleh Presiden Prabowo, merupakan masa jabatan periode yang kedua.
Dengan sejumlah capaian karirnya, pada tahun 2023 Eddy Hartono dianugerahi tanda jasa Bintang Bhayangkara Pratama. Dedikasinya menjadi pertimbangan besar akan penunjukan kembali Eddy di BNPT. dilansir rri.co.id